RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 SEMA5AQ13591 1074 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 CPZQ66K79 652 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 RETSATQ6NUM9 610 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 DEFB106AQ8N104 65 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ESX1Q8N693 406 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF26Q96DR7 871 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 LURAP1Q96LR2 239 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 E5RJQ4 531 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 PAEPP09466 180 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK17Q00537 523 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SQSTM1Q13501 440 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MYLK3Q32MK0 819 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ARTNQ5T4W7 220 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ATL2Q8NHH9 583 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 EXOC1Q9NV70 894 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.47■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 GRAP2O75791 330 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 OR1E1P30953 314 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR3P46089 330 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 CCL11P51671 97 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ENPEPQ07075 957 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC20A2Q08357 652 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 KAT5Q92993 513 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 LGR4Q9BXB1 951 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 PDP2Q9P2J9 529 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.46■□□□□ 0.07
CLSTN3-216ENST00000545663 A6NCN8 305 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 DRGXA6NNA5 263 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 CREG1O75629 220 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 FUCA1P04066 466 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ADAM9Q13443 819 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 BIRC2Q13490 618 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 TESK1Q15569 626 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 NETO2Q8NC67 525 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZPBPQ9BS86 351 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZMYND15Q9H091 742 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 THAP9Q9H5L6 903 aa15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 INPP4BO15327 924 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZW10O43264 779 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 PPP6R2O75170 966 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 YEATS4O95619 227 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 CCNB1P14635 433 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ACVRL1P37023 503 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 STK38Q15208 465 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC6A19Q695T7 634 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 PLPP6Q8IY26 295 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 MMP21Q8N119 569 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 NAGSQ8N159 534 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.44■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ILVBLA1L0T0 632 aa15.43■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 PRSS44E7EML9 344 aa15.43■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ACADSBP45954 432 aa15.43■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CLSTN3-216ENST00000545663 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms