RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	NCOR1	O75376	2440 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SLC7A4	O43246	635 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF217	O75362	1048 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PRL	P01236	227 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PRKCG	P05129	697 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ALPI	P09923	528 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TPH1	P17752	444 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MGAT1	P26572	445 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	VIPR1	P32241	457 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY2	P41231	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GRIA1	P42261	906 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PDE1B	Q01064	536 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	POU6F1	Q14863	301 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FZD4	Q9ULV1	537 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PLK4	O00444	970 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PI15	O43692	258 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ERLIN1	O75477	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PCDH8	O95206	1070 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ELFN1	P0C7U0	828 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PIRT	P0C851	137 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TIMP2	P16035	220 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF30	P17039	623 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ADRA1D	P25100	572 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DRD3	P35462	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ABL2	P42684	1182 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	METAP1	P53582	386 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	VSNL1	P62760	191 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MTM1	Q13496	603 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	IHH	Q14623	411 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SLMAP	Q14BN4	828 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TRADD	Q15628	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DPPA4	Q7L190	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658		A8MX80	341 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TSPAN6	O43657	245 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	AVIL	O75366	819 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PAM	P19021	973 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	OXTR	P30559	389 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	HNF1B	P35680	557 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MMP12	P39900	470 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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