RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 K7ESF4 209 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 AP1G1O43747 822 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ACADMP11310 421 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ARL4CP56559 192 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ANO7Q6IWH7 933 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HHIPQ96QV1 700 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 EPC1Q9H2F5 836 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 BFARQ9NZS9 450 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 E7ESA3 106 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MCM3P25205 808 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ELP6Q0PNE2 266 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ERAP2Q6P179 960 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CACUL1Q86Y37 369 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC39Q96DD0 335 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 OMDQ99983 421 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PP55 124 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 HNF1BP35680 557 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP12P39900 470 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 ABL2P42684 1182 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TPMTP51580 245 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 RANBP9Q96S59 729 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 FMO2Q99518 471 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-205ENST00000528462 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 H0Y858 1186 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SPINT1O43278 529 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF217O75362 1048 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 AVILO75366 819 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CDKN3Q16667 212 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 DPPA4Q7L190 304 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB21Q9UL25 225 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NFU1Q9UMS0 254 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEB16A2A368 324 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ALPIP09923 528 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF30P17039 623 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CTPS1P17812 591 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TAS2R38P59533 333 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 LAMB3Q13751 1172 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CENPUQ71F23 418 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PEX13Q92968 403 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PLK4O00444 970 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPAN6O43657 245 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TPH1P17752 444 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 ADRA1DP25100 572 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 VIPR1P32241 457 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 VSNL1P62760 191 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM193AP78312 1265 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE1BQ01064 536 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 MSS51Q4VC12 460 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 PCID2Q5JVF3 399 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 RELL1Q8IUW5 271 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.06■■□□□ 1.12
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