RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 APOOQ9BUR5 198 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP69A5D8W1 941 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TPP1O14773 563 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TPM3P06753 285 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TSHRP16473 764 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PEX5P50542 639 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PPARDQ03181 441 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NFATC4Q14934 902 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TCEA2Q15560 299 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CDKN3Q16667 212 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 FAXCQ5TGI0 409 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 IFI44Q8TCB0 444 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TBATAQ96M53 351 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CHP1Q99653 195 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 BOCQ9BWV1 1114 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPY26PQ9H489 355 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 LMO7DNF2Z398 122 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 YY2O15391 372 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP3K6O95382 1288 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SERPINB6P35237 376 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MTM1Q13496 603 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 IHHQ14623 411 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 HID1Q8IV36 788 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC35F3Q8IY50 421 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TEX26Q8N6G2 289 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NXPE2Q96DL1 559 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 IL12RB2Q99665 862 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 USP29Q9HBJ7 922 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CBFA2T2O43439 604 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SOCS5O75159 536 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 GP1BAP07359 652 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 H2AFZP0C0S5 128 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ELFN1P0C7U0 828 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MMP13P45452 471 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 HK3P52790 923 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 GALNT2Q10471 571 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 RTP5Q14D33 572 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CNGA3Q16281 694 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MARC1Q5VT66 337 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 H2AFVQ71UI9 128 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PQLC3Q8N755 202 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PDXPQ96GD0 296 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 LHX6Q9UPM6 363 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CPED1A4D0V7 1026 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MFAP3LO75121 409 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM253P0C7T8 217 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 LHCGRP22888 699 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM14Q14142 442 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PERM1Q5SV97 790 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PAF1Q8N7H5 531 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 FAF2Q96CS3 445 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 COQ10AQ96MF6 247 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SMIM14Q96QK8 99 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF670Q9BS34 389 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NT5MQ9NPB1 228 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0U1RQS6 177 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM202A6NGA9 273 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 CPP00450 1065 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 TGM2P21980 687 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 GBE1Q04446 702 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 NR0B2Q15466 257 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3-204ENST00000528201 KCTD6Q8NC69 237 aa24.01■■□□□ 1.43
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