RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 CES3Q6UWW8 571 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 FMO2Q99518 471 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 DKK3Q9UBP4 350 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL5AQ9Y689 179 aa22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN11A1L157 253 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ADH1BP00325 375 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ADRB3P13945 408 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 C5AR1P21730 350 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEA3P43357 314 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL4CP56559 192 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CASC4Q6P4E1 433 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TSSK4Q6SA08 328 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF778Q96MU6 729 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 OMDQ99983 421 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.83■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 CAV1Q03135 178 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 AGBL4Q5VU57 503 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 PDIK1LQ8N165 341 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMD1Q8N878 549 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CKAP5Q14008 2032 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR23AA6NEV1 266 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL22O00626 93 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 LHCGRP22888 699 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR93Q6P2C0 686 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 RLN3Q8WXF3 142 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 EID2BQ96D98 161 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 SCRN2Q96FV2 425 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN7O95471 211 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ACADMP11310 421 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ELK3P41970 407 aa22.81■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R38P59533 333 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.81■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 BFARQ9NZS9 450 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 INVSQ9Y283 1065 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 MLNP12872 115 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL12P48061 93 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 USP45Q70EL2 814 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf72Q96LT7 481 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FBRSQ9HAH7 460 aa22.8■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.8■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TPMTP51580 245 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKN3Q16667 212 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC66Q68CR7 880 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.8■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB21Q9UL25 225 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF711Q9Y462 761 aa22.8■■□□□ 1.24
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TSNARE1-208ENST00000524325 NEMP1O14524 444 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFRSF8P28908 595 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPRSS15P98073 1019 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPUQ71F23 418 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 SPOCK2Q92563 424 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP36Q96G28 342 aa22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TSNARE1-208ENST00000524325 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
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