RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523746.5

PTK2-250, Transcript of protein tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene PTK2, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTK2-250	ENST00000523746	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	SGCD	Q92629	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	WNT9B	O14905	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	MOSPD3	O75425	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PGM3	O95394	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	TFPI	P10646	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ARSB	P15848	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	THPO	P40225	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	IRF3	Q14653	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	KCTD2	Q14681	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CRYM	Q14894	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746		Q6ZSV7	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	LPAR1	Q92633	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTK2-250	ENST00000523746	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	PPEF2	O14830	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	GJB3	O75712	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	RGS11	O94810	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	NDUFB4	O95168	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	LCAT	P04180	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	CSH1	P0DML2	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	CSH2	P0DML3	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ABCG1	P45844	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	P2RX3	P56373	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	EPS8	Q12929	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	TRAF1	Q13077	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	PTGR1	Q14914	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	RABEP1	Q15276	862 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	TOMM20	Q15388	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ETFDH	Q16134	617 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTK2-250	ENST00000523746	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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