RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 SERPINA4P29622 427 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 BCL2L1Q07817 233 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ELP6Q0PNE2 266 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GRM3Q14832 879 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CFAP58Q5T655 872 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 FAXCQ5TGI0 409 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LIPIQ6XZB0 460 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TXLNBQ8N3L3 684 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LZTR1Q8N653 840 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TEKT4Q8WW24 435 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 APOOQ9BUR5 198 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LRRC61Q9BV99 259 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NOD2Q9HC29 1040 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SEPT3Q9UH03 358 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GPSM3Q9Y4H4 160 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CACNA1GO43497 2377 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 YY2O15391 372 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 OPA1O60313 960 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 MT-CO3P00414 261 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TMEM253P0C7T8 217 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TSHRP16473 764 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 YPEL5P62699 121 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TRAF2Q12933 501 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ILKQ13418 452 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 DPYSL3Q14195 570 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 KRT81Q14533 505 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SPA17Q15506 151 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ALG11Q2TAA5 492 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PERM1Q5SV97 790 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ERAP2Q6P179 960 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 GUSBP11Q6P575 273 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ENPP7Q6UWV6 458 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 HID1Q8IV36 788 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PCDH19Q8TAB3 1148 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 FAM71BQ8TC56 605 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 RFFLQ8WZ73 363 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 CRELD1Q96HD1 420 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 CLCA2Q9UQC9 943 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.08□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TMEM202A6NGA9 273 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 H3BM21 787 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 NRDCO43847 1150 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 MFSD11O43934 449 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PROSCO94903 275 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 LCA5LO95447 670 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ALPPL2P10696 532 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 CDK4P11802 303 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 TGM2P21980 687 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 HNF1BP35680 557 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SUOXP51687 545 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PPARDQ03181 441 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PTK2BQ14289 1009 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ZNF235Q14590 738 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 COL28A1Q2UY09 1125 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 HS1BP3Q53T59 392 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 DENND2CQ68D51 928 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 MACC1Q6ZN28 852 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 DPPA4Q7L190 304 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SFTPA2Q8IWL1 248 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 PAF1Q8N7H5 531 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 IFI44Q8TCB0 444 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 ZNF599Q96NL3 588 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 LGR4Q9BXB1 951 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 NT5MQ9NPB1 228 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.07□□□□□ -0.32
HPS1-211ENST00000478087 SPASTQ9UBP0 616 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms