RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	NPAS1	Q99742	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197		Q9N2J8	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	COL18A1	P39060	1754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197		A0A1B0GVM2	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZWINT	O95229	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OLFM2	O95897	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ONECUT2	O95948	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ALCAM	Q13740	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GRM7	Q14831	915 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ADCY9	O60503	1353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SUV39H1	O43463	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SOCS5	O75159	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GUCA1C	O95843	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	C1orf226	A1L170	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PTPN2	P17706	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CR2	P20023	1033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GK	P32189	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FPGS	Q05932	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RPE65	Q16518	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HSPH1	Q92598	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197		A0A1W2PS29	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BAG2	O95816	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CYP2D6	P10635	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SAT1	P21673	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CXCR3	P49682	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LBX1	P52954	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	UBASH3A	P57075	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TUBB4B	P68371	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CXADR	P78310	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MEP1B	Q16820	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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