RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CHKB	Q9Y259	395 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		A6NNZ2	444 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	MTSS1	O43312	755 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ELFN1	P0C7U0	828 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	THEGL	P0DJG4	465 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	C6	P13671	934 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CTPS1	P17812	591 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PTPN7	P35236	360 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	NXPH1	P58417	271 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IL9R	Q01113	521 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	OVGP1	Q12889	678 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	DENND2C	Q68D51	928 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZSR6	202 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IQCH	Q86VS3	1027 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ACTL9	Q8TC94	416 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	17.84	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		17.83	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	POM121B	A6NF01	834 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	HACD1	B0YJ81	288 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PDHA1	P08559	390 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PTPN3	P26045	913 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	XRCC4	Q13426	336 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	GSE1	Q14687	1217 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ACOX1	Q15067	660 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	NOMO1	Q15155	1222 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KA1	Q15418	735 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	TEX44	Q53QW1	395 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	USP45	Q70EL2	814 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	DPPA4	Q7L190	304 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	OR13H1	Q8NG92	308 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ASB12	Q8WXK4	309 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		17.83	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	DFNA5	O60443	496 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ALPI	P09923	528 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	VIPR1	P32241	457 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	CCT8	P50990	548 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RALGDS	Q12967	914 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF7	Q14155	803 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	IHH	Q14623	411 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	LRRC14	Q15048	493 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PTPRR	Q15256	657 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PCSK7	Q16549	785 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	LIPI	Q6XZB0	460 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PID1	Q7Z2X4	250 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	BMF	Q96LC9	184 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	GLOD4	Q9HC38	313 aa		17.82	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902		F5H423	210 aa	Predicted RBP	17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	MMP2	P08253	660 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RBP3	P10745	1247 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RBL1	P28749	1068 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	RABIF	P47224	123 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SKOR1	P84550	965 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	WASHC5	Q12768	1159 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SLC14A1	Q13336	389 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	TTC13	Q8NBP0	860 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	DEFB124	Q8NES8	71 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	TRIM58	Q8NG06	486 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		17.81	■□□□□ 0.44
USP19-210	ENST00000465902	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		17.81	■□□□□ 0.44

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