RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ASAP2	O43150	1006 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SEC14L5	O43304	696 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RGS14	O43566	566 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ATP2C2	O75185	946 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LCAT	P04180	440 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HOXB5	P09067	269 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TFPI	P10646	304 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ALOX12	P18054	663 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SRD5A1	P18405	259 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	EDN2	P20800	178 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ARRB2	P32121	409 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CDA	P32320	146 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	THBS3	P49746	956 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CLCN5	P51795	746 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	EGR4	Q05215	589 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TRAF2	Q12933	501 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MEA1	Q16626	185 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZSV7	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MARK4	Q96L34	752 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LDB2	O43679	373 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PAGE4	O60829	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RARG	P13631	454 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NAGA	P17050	411 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MYF6	P23409	242 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DCTD	P32321	178 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HOXD13	P35453	343 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PBX3	P40426	434 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT6	P53370	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HDAC4	P56524	1084 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PRAME	P78395	509 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TRAF1	Q13077	416 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GPS2	Q13227	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	OLIG2	Q13516	323 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CAPS	Q13938	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LPIN1	Q14693	890 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CRYM	Q14894	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MED22	Q15528	200 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HSPB2	Q16082	182 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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