RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF33AQ06730 810 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC14A1Q13336 389 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MTF1Q14872 753 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CENPPQ6IPU0 288 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZVL8 140 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 BEST2Q8NFU1 509 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 Q8TCH9 128 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA1191Q96A73 305 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 IFT74Q96LB3 600 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 STK33Q9BYT3 514 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FZD8Q9H461 694 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 POLD4Q9HCU8 107 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RLIMQ9NVW2 624 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 DKK4Q9UBT3 224 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TBX20Q9UMR3 447 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MED16Q9Y2X0 877 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SCINQ9Y6U3 715 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ITPR3Q14573 2671 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MYMKA6NI61 221 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC169A6NNP5 214 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MEI4A8MW99 385 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 K7EQS6 105 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 K7ERI5 159 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SGK1O00141 431 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 THAP12O43422 761 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC26A4O43511 780 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SLC28A2O43868 658 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 PRAMEF4O60810 478 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL18O94889 574 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 LARGE1O95461 756 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 APODP05090 189 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 EDN1P05305 212 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.642e-6■□□□□ 8.9
PTPRK-210ENST00000415055 CPA1P15085 419 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 GYPEP15421 78 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 DDCP20711 480 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HSPA7P48741 367 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RARRES1P49788 294 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RCAN1P53805 252 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 RRADP55042 308 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 POLE2P56282 527 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CXADRP78310 365 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 KDSRQ06136 332 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SPAG1Q07617 926 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 GRIK2Q13002 908 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 GPR17Q13304 367 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SP140Q13342 867 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HS1BP3Q53T59 392 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 EOGTQ5NDL2 527 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZUG5 572 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 NEK8Q86SG6 692 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 SKAP1Q86WV1 359 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 MYCT1Q8N699 235 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 STKLD1Q8NE28 680 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-210ENST00000415055 HAS1Q92839 578 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms