RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	RUNX3	Q13761	415 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	VCAN	P13611	3396 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	FZD6	O60353	706 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	RFPL1	O75677	317 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	AHSG	P02765	367 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	UGT2B4	P06133	528 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINA4	P29622	427 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	RBBP8	Q99708	897 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TPP1	O14773	563 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TYROBP	O43914	113 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GABRB3	P28472	473 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	LSP1	P33241	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MAPK8	P45983	427 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PGGT1B	P53609	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC24C	P53992	1094 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NAB1	Q13506	487 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPRN	Q16849	979 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CNTF	P26441	200 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TYK2	P29597	1187 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GJA4	P35212	333 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GMPR	P36959	345 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	MTHFR	P42898	656 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	RAD51	Q06609	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM107B	Q9H098	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	COPE	O14579	308 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	HAUS5	O94927	633 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAD9B-204	ENST00000409300	GRIA4	P48058	902 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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