RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 NFS1Q9Y697 457 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 NDC80O14777 642 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UGT1A9O60656 530 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 FGF1P05230 155 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SLCO1A2P46721 670 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PSMD8P48556 350 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 GAS6Q14393 721 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CRYMQ14894 314 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 IQCKQ8N0W5 287 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ARRDC3Q96B67 414 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.38■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 LAMA1P25391 3075 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 OR51F1A6NGY5 319 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 GPR39O43194 453 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 C1QAP02745 245 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ERVK-10P10266 1014 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ARNTP27540 789 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 NTSR1P30989 418 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 NPY2RP49146 381 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PLPP6Q8IY26 295 aa20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.851e-6■■□□□ 13
TMCO3-201ENST00000375391 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 A0A0J9YYE9 177 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 AGPSO00116 658 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.851e-8■■■■□ 20.8
TMCO3-201ENST00000375391 SOCS5O75159 536 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CLDN7O95471 211 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TRBC1P01850 177 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PRSS56P0CW18 603 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CHRNB1P11230 501 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TIMP2P16035 220 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 LHCGRP22888 699 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 RAD51Q06609 339 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 FZD5Q13467 585 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 UGP2Q16851 508 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 LONRF1Q17RB8 773 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PCID2Q5JVF3 399 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TTC7BQ86TV6 843 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM135Q86UB9 458 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 GJD3Q8N144 294 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 KDM1BQ8NB78 822 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SOX13Q9UN79 622 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 FAM155BO75949 473 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 MAPK8P45983 427 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 COPAP53621 1224 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CFAP58Q5T655 872 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 KIFC1Q9BW19 673 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.36■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CKAP5Q14008 2032 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 MAP2K7O14733 419 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 MID1O15344 667 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 HOXB2P14652 356 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 PGAM1P18669 254 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SATB1Q01826 763 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SLC14A2Q15849 920 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CDKN3Q16667 212 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 HDXQ7Z353 690 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 AGAP2Q99490 1192 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 CD248Q9HCU0 757 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 MROH6A6NGR9 719 aa20.35■□□□□ 0.85
TMCO3-201ENST00000375391 SPINT1O43278 529 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms