RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PLD5Q8N7P1 536 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HTR1BP28222 390 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SULT2A1Q06520 285 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BIKQ13323 160 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 RCN3Q96D15 328 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ADI1Q9BV57 179 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD5O75356 428 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 LCA5LO95447 670 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 CDH13P55290 713 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM11AP58511 58 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GBE1Q04446 702 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PARP15Q460N3 678 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SPESP1Q6UW49 350 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MON1BQ7L1V2 547 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TIFAQ96CG3 184 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLITRK2Q9H156 845 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL1Q9NR64 748 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MSRAQ9UJ68 235 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 COL6A2P12110 1019 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 EPORP19235 508 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TAF5Q15542 800 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PTP4A2Q12974 167 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 NETO2Q8NC67 525 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 GPR152Q8TDT2 470 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 URADA6NGE7 173 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 HTR7P34969 479 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD5Q6N075 450 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 BRD9Q9H8M2 597 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ABRQ12979 859 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GRM3Q14832 879 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SPACA7Q96KW9 195 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CDH19Q9H159 772 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CYLDQ9NQC7 956 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NELL1Q92832 810 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PANX1Q96RD7 426 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CHKBQ9Y259 395 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GLUD1P00367 558 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GNRH1P01148 92 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TCEA2Q15560 299 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 IRGQQ8WZA9 623 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PADI3Q9ULW8 664 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQH9 124 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2BP42772 138 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GLUD2P49448 558 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CHN2P52757 468 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DGCR6Q14129 220 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MECRQ9BV79 373 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MDM4O15151 490 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SNAP91O60641 907 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL14O95715 111 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN9P43378 593 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ASF1AQ9Y294 204 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC189A1A4V9 331 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms