RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336915.10

SKAP1-201, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SKAP1, Length 1,534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1-201ENST00000336915 RMI1Q9H9A7 625 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 A0A1B0GVT2 93 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 H3BRJ5 948 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 E2F6O75461 281 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ATP5HO75947 161 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ECEL1O95672 775 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 GAS8O95995 478 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 KRT14P02533 472 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 RARGP13631 454 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ARL4AP40617 200 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TUBP50607 506 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TPMTP51580 245 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 IL9RQ01113 521 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CAMK2BQ13554 666 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 PTK6Q13882 451 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TRADDQ15628 312 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 GEN1Q17RS7 908 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 HLA-BQ31612 363 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SDE2Q6IQ49 451 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 HTR3DQ70Z44 454 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SNX19Q92543 992 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 FOXJ1Q92949 421 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SLC39A13Q96H72 371 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SERPINB11Q96P15 392 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 HAPLN3Q96S86 360 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 COX16Q9P0S2 106 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 PDP2Q9P2J9 529 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 MGAQ8IWI9 3026 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ESYT3A0FGR9 886 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CBX4O00257 560 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 APOL1O14791 398 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DKK1O94907 266 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CER1O95813 267 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SLC2A3P11169 496 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 GOT1P17174 413 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DRD4P21917 467 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 PRKCHP24723 683 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ITPKBP27987 946 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 ECHS1P30084 290 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CCR1P32246 355 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 HTR7P34969 479 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 NR2C2P49116 596 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 COPAP53621 1224 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DYNLT1P63172 113 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 DPYSQ14117 519 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 MYBPC3Q14896 1274 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 NOMO1Q15155 1222 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CCDC80Q76M96 950 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 MARK1Q9P0L2 795 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SKAP1-201ENST00000336915 LRRC42Q9Y546 428 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms