RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PTPN2P17706 415 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CRABP2P29373 138 aa17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 LMAN2Q12907 356 aa17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TMEM151AQ8N4L1 468 aa17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF697Q5TEC3 545 aa17.94■□□□□ 0.46
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ACTB-201ENST00000331789 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
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ACTB-201ENST00000331789 OR6Y1Q8NGX8 325 aa17.94■□□□□ 0.46
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ACTB-201ENST00000331789 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
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ACTB-201ENST00000331789 H0YHG0 523 aa17.94■□□□□ 0.46
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ACTB-201ENST00000331789 CATSPERZQ9NTU4 200 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 KCNK4Q9NYG8 393 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 TRIM33Q9UPN9 1127 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 VWA7Q9Y334 891 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 RWDD3Q9Y3V2 267 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 C5orf67F2Z3F1 127 aa17.93■□□□□ 0.46
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