RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRRQ15256 657 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 STYXQ8WUJ0 223 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 OLFM1Q99784 485 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TK2O00142 265 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINE1P05121 402 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RALBP11234 206 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN2P17706 415 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 PFKLP17858 780 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC1A6P48664 564 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MPP7Q5T2T1 576 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CRTAMO95727 393 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GLP2RO95838 553 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 S1PR4O95977 384 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A1P02730 911 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 MYL2P10916 166 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CRABP2P29373 138 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 NTHL1P78549 312 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 POU4F1Q01851 419 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 UBE3AQ05086 875 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 DLG1Q12959 904 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3AQ14563 771 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 PER2O15055 1255 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SBK3P0C264 359 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ARRB2P32121 409 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A2P55011 1212 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.84■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 NXNL1Q96CM4 212 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS56P0CW18 603 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN5P51795 746 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RETSATQ6NUM9 610 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT7Q86SF2 657 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 FIBINQ8TAL6 211 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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VSTM4-201ENST00000298454 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 ECT2Q9H8V3 914 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 HEY2Q9UBP5 337 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.83■■□□□ 1.25
VSTM4-201ENST00000298454 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 COL6A2P12110 1019 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ABL2P42684 1182 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 OR4L1Q8NH43 312 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GPR78Q96P69 363 aa22.83■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 GRK2P25098 689 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 NCALDP61601 193 aa22.82■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 EFHBQ8N7U6 833 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ACDQ96AP0 544 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 H0YHG0 523 aa22.82■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 KLHL2O95198 593 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CYBBP04839 570 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LCA5Q86VQ0 697 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM25Q86YD3 366 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GPR150Q8NGU9 434 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1EQ8WY54 764 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 SORT1Q99523 831 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.82■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087X1B8 175 aa22.81■■□□□ 1.24
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