RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A4O43246 635 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CISD3P0C7P0 127 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSAP15289 507 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TAC1P20366 129 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CRHR1P34998 444 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS15P98073 1019 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE1BQ01064 536 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GAB4Q2WGN9 574 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX13Q92968 403 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEB18Q96M61 343 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR22Q99680 433 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOJQ9H4E5 214 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX15Q9NRS6 342 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC1BQ9P126 229 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HAUS5O94927 633 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PGLSO95336 258 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMA3P25788 255 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 IL9RQ01113 521 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 EID2BQ96D98 161 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GDE1Q9NZC3 331 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 COL4A3Q01955 1670 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFAB1O14561 156 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ABL2P42684 1182 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ECT2LQ008S8 904 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PDK4Q16654 411 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 EBF3Q9H4W6 596 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 EMCNQ9ULC0 261 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM44O43615 452 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GSRP00390 522 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ADH5P11766 374 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TYK2P29597 1187 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MBLAC2Q68D91 279 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 STYXQ8WUJ0 223 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO19Q96H55 970 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM15Q13444 863 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA3AQ14563 771 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DMC1Q14565 340 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HHATQ5VTY9 493 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CNSTQ6PJW8 725 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 AHI1Q8N157 1196 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 S1PR5Q9H228 398 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR91A4D1P6 747 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CRTAMO95727 393 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF6O95976 241 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ALPIP09923 528 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT5P48643 541 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB8P50452 374 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEP78395 509 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms