RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262829.11

RBFOX2-201, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFOX2, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 GRM3Q14832 879 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CDKN3Q16667 212 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HS1BP3Q53T59 392 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HID1Q8IV36 788 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RAPGEF5Q92565 580 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RAXQ9Y2V3 346 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CPED1A4D0V7 1026 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 GM2AP17900 193 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MMP13P45452 471 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 AP1S1P61966 158 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 GBE1Q04446 702 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ITKQ08881 620 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TRAF2Q12933 501 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ACOX1Q15067 660 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 LIPIQ6XZB0 460 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PROSER1Q86XN7 944 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 IFT43Q96FT9 208 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF599Q96NL3 588 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 APOOQ9BUR5 198 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 LRRC61Q9BV99 259 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CLPBQ9H078 707 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.62□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NEMP2A6NFY4 417 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 H3BM21 787 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TPM1P09493 284 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TMEM253P0C7T8 217 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ELFN1P0C7U0 828 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CTPS1P17812 591 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CR2P20023 1033 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ACP1P24666 158 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RENBPP51606 427 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TRIM14Q14142 442 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 IHHQ14623 411 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MARC1Q5VT66 337 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PQLC3Q8N755 202 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 FAM71BQ8TC56 605 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CCDC42Q96M95 316 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TFR2Q9UP52 801 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 C1SP09871 688 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ALPPL2P10696 532 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CKMT1AP12532 417 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TSHRP16473 764 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SERPINB6P35237 376 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SUOXP51687 545 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PPARDQ03181 441 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PTK2BQ14289 1009 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 LLGL1Q15334 1064 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ALG11Q2TAA5 492 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 GUSBP11Q6P575 273 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MACC1Q6ZN28 852 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 DPPA4Q7L190 304 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SEMA3CQ99985 751 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MGME1Q9BQP7 344 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TRIM5Q9C035 493 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.61□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 LRRD1A4D1F6 860 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TMEM202A6NGA9 273 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 YY2O15391 372 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CPP00450 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PDHA1P08559 390 aa14.6□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ALPIP09923 528 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms