RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 ATG16L1Q676U5 607 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 CGB2Q6NT52 195 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SPRED2Q7Z698 418 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 SRLQ86TD4 932 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.58□□□□□ -0.88
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APOBEC1-201ENST00000229304 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
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APOBEC1-201ENST00000229304 JUNDP17535 347 aa9.57□□□□□ -0.88
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APOBEC1-201ENST00000229304 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.57□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087X1B8 175 aa9.56□□□□□ -0.88
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF12O95522 483 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 GLP2RO95838 553 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 MT-CO1P00395 513 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 NEFHP12036 1026 aa9.56□□□□□ -0.88
APOBEC1-201ENST00000229304 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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