RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEH1Q9H213 219 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEPT3Q9UH03 358 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LAMA5O15230 3695 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PPP6CO00743 305 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OLFM2O95897 454 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ABHD2P08910 425 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SRCP12931 536 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DRD4P21917 467 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDC25CP30307 473 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEC13P55735 322 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 USP4Q13107 963 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHI3L2Q15782 390 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TTC7BQ86TV6 843 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SCYL1Q96KG9 808 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SOX13Q9UN79 622 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.61□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ILVBLA1L0T0 632 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KDELR3O43731 214 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TULP3O75386 442 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KCNA5P22460 613 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRE1Q14246 886 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PCID2Q5JVF3 399 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PELI3Q8N2H9 469 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FLCNQ8NFG4 579 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDKL2Q92772 493 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KLK6Q92876 244 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FOXJ1Q92949 421 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CABS1Q96KC9 395 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 VAT1Q99536 393 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LHX3Q9UBR4 397 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SARDHQ9UL12 918 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IRAK3Q9Y616 596 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MTSS1O43312 755 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NIPSNAP2O75323 286 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KRT38O76015 456 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ASGR2P07307 311 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SERPINB4P48594 390 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDH13P55290 713 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HYAL1Q12794 435 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DHCR24Q15392 516 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHST9Q7L1S5 443 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM74Q86UV6 250 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MYADMQ96S97 322 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HBEGFQ99075 208 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ARMCX1Q9P291 453 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EMCNQ9ULC0 261 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 A6NNZ2 444 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM233B4DJY2 109 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LIG3P49916 1009 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDKN2DP55273 166 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DMTNQ08495 405 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 BST1Q10588 318 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.6□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms