RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRAMEP78395 509 aa22.14■■□□□ 1.14
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 SQLEQ14534 574 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GK5Q6ZS86 529 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 PHF21BQ96EK2 531 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NOD1Q9Y239 953 aa22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBX18O95935 607 aa22.14■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 RNF148Q8N7C7 305 aa22.14■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 RGMBQ6NW40 437 aa22.13■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM38O00635 465 aa22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OR1G1P47890 313 aa22.12■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 FLT3LGP49771 235 aa22.12■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 SERINC3Q13530 473 aa22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTK2BQ14289 1009 aa22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PARP15Q460N3 678 aa22.12■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 GCNAQ96QF7 691 aa22.12■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PEX13Q92968 403 aa22.12■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 OR51F1A6NGY5 319 aa22.11■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 AP1G1O43747 822 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IGLV3-27P01718 113 aa22.11■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRP8Q14114 963 aa22.11■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.11■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.11■■□□□ 1.13
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SYN3O14994 580 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ETFBP38117 255 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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