RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZACNQ401N2 412 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 LAYNQ6UX15 382 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RRAGAQ7L523 313 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIAA1328Q86T90 577 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERINC5Q86VE9 423 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT73Q86Y46 540 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM58Q8NG06 486 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CAGE1Q8TC20 777 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATA18Q8TC71 538 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SHC3Q92529 594 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF566Q969W8 418 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF560Q96MR9 790 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRRX2Q99811 253 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCHPQ9BT92 498 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAB20Q9NX57 234 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 RNF186Q9NXI6 227 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A087WZ62 844 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A1W2PPC4 97 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNM1LO00429 736 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYR61O00622 381 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF185O15231 689 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NCK2O43639 380 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIAP1O43715 76 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPAN1O60635 241 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF10O60809 474 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM20BO75063 409 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 VPS4BO75351 444 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NOL4O94818 638 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD4P01730 458 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM163BP0C2L3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM49P0CI25 452 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM49CP0CI26 452 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYBL1P10243 752 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYL4P12829 197 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 C6P13671 934 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGALP20701 1170 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABCB4P21439 1286 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGFR4P22455 802 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL1R2P27930 398 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPM1AP35813 382 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GDF5P43026 501 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms