RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ASB9Q96DX5 294 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MUS81Q96NY9 551 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PIF1Q9H611 641 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RAD51BO15315 384 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFS2O75306 463 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RGS20O76081 388 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CALB1P05937 261 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ALOX5P09917 674 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MMP8P22894 467 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLC7A1P30825 629 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2C18P33260 490 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SHMT2P34897 504 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CASP3P42574 277 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VBP1P61758 197 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PPP2R2BQ00005 443 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OLIG2Q13516 323 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AGKQ53H12 422 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DESI1Q6ICB0 168 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SDE2Q6IQ49 451 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LEMD2Q8NC56 503 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VPS33AQ96AX1 596 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OMA1Q96E52 524 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ING2Q9H160 280 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SPC25Q9HBM1 224 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 H0YCG3 227 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TK2O00142 265 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AP3D1O14617 1153 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G6O60733 806 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL2O75678 378 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 INMTO95050 263 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 METTL18O95568 372 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRT-211ENST00000618610 CAPN1P07384 714 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 WEE1P30291 646 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NAGLUP54802 743 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CDH6P55285 790 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GALK2Q01415 458 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GEN1Q17RS7 908 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLC36A3Q495N2 470 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ADCK1Q86TW2 530 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PQLC3Q8N755 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LPAR1Q92633 364 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC11Q96DB2 347 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MED30Q96HR3 178 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DACH2Q96NX9 599 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VPS35Q96QK1 796 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CISHQ9NSE2 258 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DPP3Q9NY33 737 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 IL37Q9NZH6 218 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 COX16Q9P0S2 106 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FAM159BA6NKW6 160 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NRP2O60462 931 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TTKP33981 857 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BAG6P46379 1132 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 XKR3Q5GH77 459 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DHFR2Q86XF0 187 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DDIASQ8IXT1 998 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SCML4Q8N228 414 aa8.24□□□□□ -1.09
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