RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RAD54LQ92698 747 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ART4Q93070 314 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TWNKQ96RR1 684 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 STIM2Q9P246 746 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ACANP16112 2415 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 AGPSO00116 658 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ATP9BO43861 1147 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MGRN1O60291 552 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 IMPDH2P12268 514 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GLB1P16278 677 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FERP16591 822 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ABHD18Q0P651 414 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RAB41Q5JT25 222 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 UNC93AQ86WB7 457 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TRIM58Q8NG06 486 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZNF516Q92618 1163 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.84□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ATRQ13535 2644 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PHACTR2O75167 634 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB5O75953 348 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K6O95382 1288 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MOCS3O95396 460 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 F8A1P23610 371 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CMA1P23946 247 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GGCXP38435 758 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PSMD6Q15008 389 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF699Q32M78 642 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MACC1Q6ZN28 852 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZVU0 165 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TEX9Q8N6V9 391 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 BMPERQ8N8U9 685 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RANBP9Q96S59 729 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MFRPQ9BY79 579 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RDH14Q9HBH5 336 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GPR34Q9UPC5 381 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 POLHQ9Y253 713 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.83□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LRP4O75096 1905 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PRSS44E7EML9 344 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FPGTO14772 594 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ACSL4O60488 711 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PCDH8O95206 1070 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GCNT3O95395 438 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CPNE6O95741 557 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GSTA1P08263 222 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DRD2P14416 443 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TNNI1P19237 187 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 STAT5AP42229 794 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HDAC4P56524 1084 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 B4GALNT1Q00973 533 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 INCA1Q0VD86 236 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TRPC3Q13507 836 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NAA25Q14CX7 972 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ELOCQ15369 112 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.82□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 EMBQ6PCB8 327 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms