RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MOB3C	Q70IA8	216 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	HASPIN	Q8TF76	798 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MEGF6	O75095	1541 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	RHOD	O00212	210 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MLYCD	O95822	493 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	POU1F1	P28069	291 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARSF	P54793	590 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CFHR1	Q03591	330 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	STIM1	Q13586	685 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMIM5	Q71RC9	77 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	5.5	□□□□□ -1.53	2e-6	■■■□□ 18.5
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC89	Q8N998	374 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PIGB	Q92521	554 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	USP6NL	Q92738	828 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	GHITM	Q9H3K2	345 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	RTL1	A6NKG5	1358 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	USP54	Q70EL1	1684 aa		5.5	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PASK	Q96RG2	1323 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	C4B	P0C0L5	1744 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCNT	O95613	3336 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	AP3D1	O14617	1153 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	UGDH	O60701	494 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	FSHB	P01225	129 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRKCG	P05129	697 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ALOX12	P18054	663 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	NFKBIA	P25963	317 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	YWHAQ	P27348	245 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CIITA	P33076	1130 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLCNKB	P51801	687 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	EFNA5	P52803	228 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PMPCA	Q10713	525 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITPK1	Q13572	414 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TAF11	Q15544	211 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SYTL3	Q4VX76	610 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ALG10	Q5BKT4	473 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATG9B	Q674R7	924 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	AAGAB	Q6PD74	315 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM57B	Q71RH2	274 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PERP	Q96FX8	193 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEDD4L-231	ENST00000590694	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53

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