RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	RHOD	O00212	210 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	TAF4	O00268	1085 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	EBAG9	O00559	213 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	UGDH	O60701	494 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	NDUFS3	O75489	264 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A12	O75746	678 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPN2	P17706	415 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	SRD5A1	P18405	259 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	SHMT1	P34896	483 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	GABRB2	P47870	512 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	STAT2	P52630	851 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	CAPS	Q13938	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	IGSF11	Q5DX21	431 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	AAGAB	Q6PD74	315 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2A14	Q96R47	310 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf226	A1L170	272 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	KLK8	O60259	260 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF8	O76064	485 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	GGPS1	O95749	300 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TFEB	P19484	476 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CPT2	P23786	658 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PON1	P27169	355 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CAPZA2	P47755	286 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SORD	Q00796	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CAMK2D	Q13557	499 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ESCO2	Q56NI9	601 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SNX32	Q86XE0	403 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CAGE1	Q8TC20	777 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	EME1	Q96AY2	570 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC14	Q96N46	770 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	UROC1	Q96N76	676 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HRH4	Q9H3N8	390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DPPA5	A6NC42	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HCRTR2	O43614	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ETFA	P13804	333 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT4	P19013	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PTGER1	P34995	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PTH2R	P49190	550 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	LMAN1	P49257	510 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CENPA	P49450	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SUOX	P51687	545 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RAD23A	P54725	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ALG10	Q5BKT4	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DPP10	Q8N608	796 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB2	Q8N680	514 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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