RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	YME1L1	Q96TA2	773 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT84	Q9NSB2	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPP6	Q9NZW5	540 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MED14	O60244	1454 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATP10A	O60312	1499 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	BRCA2	P51587	3418 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLKB1	P03952	638 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCNA	P12004	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNAQ	P50148	359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	P2RX3	P56373	397 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTP4A2	Q12974	167 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITGAD	Q13349	1161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PKP1	Q13835	747 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF6	Q15052	776 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q5PR19	223 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIP4P1	Q86T03	277 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	KDM1B	Q8NB78	822 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	GJC3	Q8NFK1	279 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	INPP5D	Q92835	1189 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIP5K1A	Q99755	562 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDT1	Q9H211	546 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADCY9	O60503	1353 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP3K1	Q13233	1512 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	HECW1	Q76N89	1606 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSPB2	A8KAH6	182 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494		B4DGG1	531 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLRF2	D3W0D1	207 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	LDLRAD4	O15165	306 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFSF14	O43557	240 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITM2A	O43736	263 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIAS	O43766	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MOSPD3	O75425	235 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	RGS11	O94810	467 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFNA2	P01563	188 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYZAP	P0CAP1	466 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	IRF1	P10914	325 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTPN2	P17706	415 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAPN3	P20807	821 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCP2	P22307	547 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTGER1	P34995	402 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	EFNA5	P52803	228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLDN2	P57739	230 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSPB2	Q16082	182 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEDD4L-222	ENST00000588494	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		3.19	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms