RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-214	ENST00000582717	CHRNG	P07510	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GRIA4	P48058	902 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IRF9	Q00978	393 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ANO4	Q32M45	955 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DPF3	Q92784	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717		A0A1W2PQH9	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MAGEB16	A2A368	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PAGE1	O75459	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DPP6	P42658	865 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	COG7	P83436	770 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CARM1	Q86X55	608 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GBA3	Q9H227	469 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARVCF	O00192	962 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	AP2A1	O95782	977 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CD1E	P15812	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NFKB1	P19838	968 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GATM	P50440	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GPNMB	Q14956	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DDR2	Q16832	855 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717		H3BNH8	94 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NBN	O60934	754 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	COL6A2	P12110	1019 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GRK4	P32298	578 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CYP2C18	P33260	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CSRP3	P50461	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SCNN1B	P51168	640 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NUP107	P57740	925 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IKBKE	Q14164	716 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GPR22	Q99680	433 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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