RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 FRMD6Q96NE9 622 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TRIB3Q96RU7 358 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GABRG3Q99928 467 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CHRDQ9H2X0 955 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 WNT16Q9UBV4 365 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GGT7Q9UJ14 662 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.4□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 HACD1B0YJ81 288 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 IFNB1P01574 187 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TUBB4AP04350 444 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 VSIG8P0DPA2 414 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ADRA1AP35348 466 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 FNTAP49354 379 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF33AQ06730 810 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DMWDQ09019 674 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PTK6Q13882 451 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DMC1Q14565 340 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 KCNJ11Q14654 390 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PCSK7Q16549 785 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 SYT9Q86SS6 491 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 EDAQ92838 391 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ACDQ96AP0 544 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ARRDC3Q96B67 414 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC114Q96M63 670 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF599Q96NL3 588 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 SEMA3CQ99985 751 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 APOL2Q9BQE5 337 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 GBA3Q9H227 469 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 GLOD4Q9HC38 313 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC188H7C350 402 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 NCAM2O15394 837 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 AVILO75366 819 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 KRT14P02533 472 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TDGF1P13385 188 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 EDN3P14138 238 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 GM2AP17900 193 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CHRNA3P32297 505 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DRD3P35462 400 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CD86P42081 329 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 TNFRSF4P43489 277 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 MAP2K3P46734 347 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DR1Q01658 176 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PFKPQ01813 784 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 SATB1Q01826 763 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 PRKCQQ04759 706 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 HYAL2Q12891 473 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 GALNT3Q14435 633 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 MARC1Q5VT66 337 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 DUPD1Q68J44 220 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 SRLQ86TD4 932 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-211ENST00000561438 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms