RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	CTSE	P14091	401 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	GPD1	P21695	349 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHB2	P29323	1055 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	UGT1A5	P35504	534 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX5	P50542	639 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	INHBC	P55103	352 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	JAM2	P57087	298 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SERINC3	Q13530	473 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	INPP5A	Q14642	412 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CYTH1	Q15438	398 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR59	Q6PJI9	974 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EXD3	Q8N9H8	876 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PDXP	Q96GD0	296 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	APOO	Q9BUR5	198 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPAN11	A1L157	253 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	AGRP	O00253	132 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CCP110	O43303	1012 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC28A2	O43868	658 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PRKCG	P05129	697 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PCCB	P05166	539 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CCKBR	P32239	447 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SOX5	P35711	763 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP12	P39900	470 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	LIG3	P49916	1009 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ELP6	Q0PNE2	266 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	UGP2	Q16851	508 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00303	Q3SY05	128 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	GKN2	Q86XP6	184 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	JAML	Q86YT9	394 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR156	Q8NFN8	814 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR92	Q96MX6	357 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CLMP	Q9H6B4	373 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PDF	Q9HBH1	243 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	KL	Q9UEF7	1012 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PISD	Q9UG56	409 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CREB3	O43889	395 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ITIH1	P19827	911 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	HTR1B	P28222	390 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	RGR	P47804	291 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SUOX	P51687	545 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	AGER	Q15109	404 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	PARP15	Q460N3	678 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	STRADB	Q9C0K7	418 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS16	Q9H269	839 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF22	Q9HCT0	170 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM202	A6NGA9	273 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931		J3KR12	359 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	ETV5	P41161	510 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-231	ENST00000551931	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38

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