RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TCEAL1Q15170 157 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ERAP2Q6P179 960 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SARM1Q6SZW1 724 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DHRS13Q6UX07 377 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 VSIG1Q86XK7 387 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TEX26Q8N6G2 289 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 FAF2Q96CS3 445 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MGME1Q9BQP7 344 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNF670Q9BS34 389 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KLF15Q9UIH9 416 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LRRK1Q38SD2 2015 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNF487B1APH4 448 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 H3BM21 787 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 AKR1B10O60218 316 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MFAP3LO75121 409 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GP1BAP07359 652 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KRT7P08729 469 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TPM1P09493 284 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ALPPL2P10696 532 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 C6P13671 934 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ARHGAP25P42331 645 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LIG3P49916 1009 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SCNN1BP51168 640 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 THOP1P52888 689 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 RALGDSQ12967 914 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DPYSL3Q14195 570 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HS1BP3Q53T59 392 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CFAP58Q5T655 872 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MACC1Q6ZN28 852 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DPPA4Q7L190 304 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PROSER1Q86XN7 944 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CNGA4Q8IV77 575 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 BBS5Q8N3I7 341 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PGBD5Q8N414 524 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TSGA13Q96PP4 275 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 AMACRQ9UHK6 382 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 INTUQ9ULD6 942 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 K7ESM1 405 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TAF4O00268 1085 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KRT37O76014 449 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CD48P09326 243 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 JUNDP17535 347 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 CES1P23141 567 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 HNF1BP35680 557 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TRIM23P36406 574 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MMP13P45452 471 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 TAS2R40P59535 323 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 GALNT2Q10471 571 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MMRN1Q13201 1228 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MTM1Q13496 603 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 KRT81Q14533 505 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNF235Q14590 738 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 IRF4Q15306 451 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 MARC1Q5VT66 337 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LRRC38Q5VT99 294 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 LIPIQ6XZB0 460 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-223ENST00000551137 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms