RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 RANBP9Q96S59 729 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GPR22Q99680 433 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RNF39Q9H2S5 420 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PLK2Q9NYY3 685 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TARM1B6A8C7 271 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ATE1O95260 518 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 NCAM1P13591 858 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 CDH13P55290 713 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 OSTM1Q86WC4 334 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GPR78Q96P69 363 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 OSMRQ99650 979 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 IL22Q9GZX6 179 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PIF1Q9H611 641 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TADA2AO75478 443 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RHDQ02161 417 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SLC12A1Q13621 1099 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 LRP8Q14114 963 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SEPT6Q14141 434 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 USP41Q3LFD5 358 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GPR107Q5VW38 600 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 KCTD11Q693B1 232 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 STRADAQ7RTN6 431 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 IFNEQ86WN2 208 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 CNTD1Q8N815 330 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SNX25Q9H3E2 840 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SMOXQ9NWM0 555 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 NOD1Q9Y239 953 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 HEATR9A2RTY3 570 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 DFFAO00273 331 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 MRASO14807 208 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 FYNP06241 537 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 CCDC166P0CW27 439 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ALDH3B2P48448 385 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 OGFOD2Q6N063 350 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 CYGBQ8WWM9 190 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 DLG3Q92796 817 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 C3orf30Q96M34 536 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 FAM210AQ96ND0 272 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SIK2Q9H0K1 926 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 VPS28Q9UK41 221 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 UBDO15205 165 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PMPCBO75439 489 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GPC4O75487 556 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GNRH1P01148 92 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 LRPAP1P30533 357 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SLC1A2P43004 574 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PLCL1Q15111 1095 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 FNDC8Q8TC99 324 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GIPC3Q8TF64 312 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ISOC1Q96CN7 298 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 HAUS8Q9BT25 410 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 MED10Q9BTT4 135 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RHOJQ9H4E5 214 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PPW3 197 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 B4GAT1O43505 415 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 USP17L7P0C7H9 530 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 SETSIPP0DME0 302 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ARNTP27540 789 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ADRA1BP35368 520 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TKTL1P51854 596 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 PCSK7Q16549 785 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RETREG3Q86VR2 466 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 DSEQ9UL01 958 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PQY0 241 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 J3QRK9 145 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 TRIM24O15164 1050 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 RECQL4O94761 1208 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 STMN1P16949 149 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-214ENST00000543184 OXTRP30559 389 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms