RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526105.5

SLC38A6-208, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-208	ENST00000526105	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PDILT	Q8N807	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	UTY	O14607	1347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TAF4	O00268	1085 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ASAP2	O43150	1006 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SEC14L5	O43304	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TIPRL	O75663	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	RGS11	O94810	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NDUFB4	O95168	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ETFA	P13804	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CD58	P19256	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CDA	P32320	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ICAM3	P32942	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	GRIK3	Q13003	919 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MYMK	A6NI61	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SPRY3	O43610	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	LAMP2	P13473	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NAGA	P17050	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	THPO	P40225	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PBX3	P40426	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	RFX2	P48378	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CXCR3	P49682	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MED22	Q15528	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105		Q6ZSV7	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms