RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT35Q92764 455 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 FATE1Q969F0 183 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MGME1Q9BQP7 344 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A1W2PQ67 120 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 C10orf142B7Z368 130 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 VILLO15195 856 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MAGEC1O60732 1142 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SOCS5O75159 536 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT10P13645 584 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CCNB1P14635 433 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TGM2P21980 687 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NFKBIAP25963 317 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CTNNA2P26232 953 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NR2C2P49116 596 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 RWDD2BP57060 319 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 COPS2P61201 443 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LLGL1Q15334 1064 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 UGP2Q16851 508 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF284Q2VY69 593 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LAYNQ6UX15 382 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NPNTQ6UXI9 565 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PGBD5Q8N414 524 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TEX26Q8N6G2 289 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MAML1Q92585 1016 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LGMNQ99538 433 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MYOCQ99972 504 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 GAREM1Q9H706 876 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 IL21RQ9HBE5 538 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 AMACRQ9UHK6 382 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ITM2BQ9Y287 266 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPAN11A1L157 253 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 AREL1O15033 823 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC175P0C221 793 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CES1P23141 567 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PPP2R5EQ16537 467 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TAZQ16635 292 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF19Q2TAC6 998 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 P3H4Q92791 437 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 VOPP1Q96AW1 172 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SEMA3CQ99985 751 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NOD2Q9HC29 1040 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 GGT7Q9UJ14 662 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0U1RQJ8 604 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLON5A6NGN9 336 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNK1O00180 336 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MMP20O60882 483 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TM7SF2O76062 418 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 JCHAINP01591 159 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CR2P20023 1033 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CA4P22748 312 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 OVGP1Q12889 678 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 HLA-BQ31612 363 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 IQCHQ86VS3 1027 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-206ENST00000520462 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms