RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC172P0C7W6 258 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 C6P13671 934 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 HTR1BP28222 390 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 RHDQ02161 417 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SPIDRQ14159 915 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 NFATC4Q14934 902 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ERAP2Q6P179 960 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PCSK4Q6UW60 755 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL10Q8N8L6 244 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ANO10Q9NW15 660 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.75■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 RASGRP1O95267 797 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 FERP16591 822 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MMP12P39900 470 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ALG11Q2TAA5 492 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP58Q5T655 872 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 HID1Q8IV36 788 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL14Q8N4G2 192 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ATL2Q8NHH9 583 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 WBP1Q96G27 269 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.74■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 J3KR12 359 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CTSEP14091 401 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CSNK1DP48730 415 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PDX1P52945 283 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 OGDHQ02218 1023 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF843Q8N446 348 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 APOOQ9BUR5 198 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 TENM4Q6N022 2769 aa22.73■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC187A0A096LP49 1063 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP69A5D8W1 941 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CAPN8A6NHC0 703 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 LIG3P49916 1009 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MTM1Q13496 603 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 INPP5AQ14642 412 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 STX1AQ16623 288 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP40Q5TG30 622 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC14AQ86T13 490 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 GKN2Q86XP6 184 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KYQ8NBH2 561 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KLQ9UEF7 1012 aa22.72■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SERPINA4P29622 427 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 VAC14Q08AM6 782 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR92Q96MX6 357 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 SYT11Q9BT88 431 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 PARVAQ9NVD7 372 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 GULP1Q9UBP9 304 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO6Q9UM54 1294 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 OR1A2Q9Y585 309 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.71■■□□□ 1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGA2BP08514 1039 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 CFHR1Q03591 330 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 MAMLD1Q13495 774 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SRLQ86TD4 932 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR34Q9UPC5 381 aa22.7■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.69■■□□□ 1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms