RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 C1RP00736 705 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA6P08185 405 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GRIA4P48058 902 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 IDH3AP50213 366 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 LAMB3Q13751 1172 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RCN2Q14257 317 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.83■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GYG2O15488 501 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 INSIG1O15503 277 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TUBB3Q13509 450 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TXNDC8Q6A555 127 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RINLQ6ZS11 566 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TRIB3Q96RU7 358 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 H0Y626 953 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 DIAPH2O60879 1101 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TBL1XO60907 577 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 F11P03951 625 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RAG1P15918 1043 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CPA2P48052 419 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 NAGLUP54802 743 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CSHL1Q14406 222 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CYTH1Q15438 398 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CFAP157Q5JU67 520 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TTC8Q8TAM2 541 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RMDN1Q96DB5 314 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CDH19Q9H159 772 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TLE6Q9H808 572 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.82■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TARM1B6A8C7 271 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ZNF195O14628 629 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CHUKO15111 745 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 S1PR4O95977 384 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CHRNGP07510 517 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ACVR1Q04771 509 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 LINGO4Q6UY18 593 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ITIH5Q86UX2 942 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM13CQ8NE31 585 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SGF29Q96ES7 293 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 DLX3O60479 287 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 SNAP91O60641 907 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GLP2RO95838 553 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 HDCP19113 662 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CCR10P46092 362 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP8P85298 464 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 FSCBQ5H9T9 825 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GALNT7Q86SF2 657 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 BHMTQ93088 406 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 DRC3Q9H069 523 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 COG4Q9H9E3 785 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 GPAMQ9HCL2 828 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 VWA7Q9Y334 891 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CPQQ9Y646 472 aa16.81■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 CR2P20023 1033 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 PPM1AP35813 382 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 PRKAA2P54646 552 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 ARF5P84085 180 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 KDSRQ06136 332 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.8■□□□□ 0.28
TOM1-216ENST00000492723 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms