RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 PARM1Q6UWI2 310 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 RRM2BQ7LG56 351 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ASB5Q8WWX0 329 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 RNF183Q96D59 192 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 WBP1Q96G27 269 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 LMLNQ96KR4 655 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ISCUQ9H1K1 167 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 KRT84Q9NSB2 600 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 DECR2Q9NUI1 292 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PLK2Q9NYY3 685 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ABI3Q9P2A4 366 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 INSL5Q9Y5Q6 135 aa3.4□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 A0A1B0GVT2 93 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TAF4O00268 1085 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GJB3O75712 270 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TFP02787 698 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 LCATP04180 440 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 IL7RP16871 459 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PIGAP37287 484 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ME1P48163 572 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GNAQP50148 359 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 OLR1P78380 273 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM27E3Q08E93 113 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PPP2R5BQ15173 497 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 KRT71Q3SY84 523 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 LCTLQ6UWM7 567 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TMC8Q8IU68 726 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 RBFAQ8N0V3 343 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 NGEFQ8N5V2 710 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SNAPC3Q92966 411 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SAAL1Q96ER3 474 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 EVPLQ92817 2033 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.39□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 INAFM1C9JVW0 142 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TIMM23O14925 209 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PAGE4O60829 102 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GFPT2O94808 682 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TOMM40O96008 361 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 CYC1P08574 325 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 LAMP2P13473 410 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 RARGP13631 454 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 ETFAP13804 333 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 PTPN2P17706 415 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 AGAP20933 346 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GNLYP22749 145 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 TM4SF1P30408 202 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 MLH1P40692 756 aa3.38□□□□□ -1.87
SENP6-208ENST00000483859 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms