RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FOLR3P41439 243 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AMPHP49418 695 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SHBQ15464 509 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SMU1Q2TAY7 513 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 IQCHQ86VS3 1027 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST13Q8NET6 341 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP85Q9BW27 656 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 GDE1Q9NZC3 331 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 EMSYQ7Z589 1322 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0A0MQY5 61 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LNP1A1A4G5 178 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6C76A6NM76 312 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PATE3B3GLJ2 98 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NUAK1O60285 661 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EBLN1P0CF75 366 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGAMP11215 1152 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1A1P14550 325 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TACR2P21452 398 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SUOXP51687 545 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RALGDSQ12967 914 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIK3Q13003 919 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD5Q13467 585 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MORF4L2Q15014 288 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PLK5Q496M5 336 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ASB10Q8WXI3 467 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LPGAT1Q92604 370 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MGME1Q9BQP7 344 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.19□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EBAG9O00559 213 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A17O43808 307 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GPC4O75487 556 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN15O95858 294 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PCNAP12004 261 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NR4A1P22736 598 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 YWHAQP27348 245 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 IDUAP35475 653 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 BMXP51813 675 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGGTB-209ENST00000473406 ECT2LQ008S8 904 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC18A2Q05940 514 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL9Q07325 125 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB2AQ13885 445 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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