RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PCLAFQ15004 111 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT24Q2M2I5 525 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 USP41Q3LFD5 358 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KCTD6Q8NC69 237 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR150Q8NGU9 434 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SNAPC3Q92966 411 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL8Q96CD0 374 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF333Q96JL9 665 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CDT1Q9H211 546 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NENFQ9UMX5 172 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPB6O14558 160 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP2C2O75185 946 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBBP07437 444 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 C6P13671 934 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ETFAP13804 333 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SELLP14151 372 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 AGAP20933 346 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PON1P27169 355 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFSF8P32971 234 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SHMT1P34896 483 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GALCP54803 685 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBED6P86452 979 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ADIPOQQ15848 244 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ESCO2Q56NI9 601 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CES5AQ6NT32 575 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PCSK4Q6UW60 755 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NOXA1Q86UR1 476 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HACE1Q8IYU2 909 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 Q8N1X5 172 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HASPINQ8TF76 798 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 OTULINQ96BN8 352 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2A14Q96R47 310 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FIZ1Q96SL8 496 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PLK3Q9H4B4 646 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SETD4Q9NVD3 440 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2A25A4D2G3 310 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY2A6NKD2 308 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TPPPO94811 219 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN7O95471 211 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 IGLV2-14P01704 120 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY3P0CV98 308 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPY8P0CW00 308 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTN1P12814 892 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 DCTDP32321 178 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CXCR3P49682 368 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 INHBCP55103 352 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PROK1P58294 105 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms