RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463477.5

PTPRD-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 1,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-207ENST00000463477 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RASSF3Q86WH2 238 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RIN3Q8TB24 985 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MSANTD3Q96H12 275 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PRRX2Q99811 253 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MECRQ9BV79 373 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TKTL2Q9H0I9 626 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 YY1AP1Q9H869 796 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OSER1Q9NX31 292 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 COX16Q9P0S2 106 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SOX13Q9UN79 622 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 KCNK1O00180 336 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 LEFTY2O00292 366 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 GSC2O15499 205 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 IRAK2O43187 625 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TIMM44O43615 452 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TLR5O60602 858 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SERPINE1P05121 402 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SERPINA6P08185 405 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 EPHB2P29323 1055 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 POLD2P49005 469 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CSRP3P50461 194 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CRADDP78560 199 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 USP4Q13107 963 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RUNX3Q13761 415 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PRPSAP1Q14558 356 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PCLAFQ15004 111 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PDGFRLQ15198 375 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CMPK2Q5EBM0 449 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FAM182AQ5T1J6 154 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MANEALQ5VSG8 457 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SCD5Q86SK9 330 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TAC4Q86UU9 113 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ARHGAP24Q8N264 748 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ARHGAP18Q8N392 663 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TMEM105Q8N8V8 129 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OR52K1Q8NGK4 314 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 STON2Q8WXE9 905 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TBC1D31Q96DN5 1066 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZFYVE19Q96K21 471 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MIPEPQ99797 713 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CCSER2Q9H7U1 834 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NMUR1Q9HB89 426 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ABCC13Q9NSE7 274 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NEU3Q9UQ49 428 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PSAT1Q9Y617 370 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CPQQ9Y646 472 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PIAS3Q9Y6X2 628 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OBSL1O75147 1896 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CACNA1HO95180 2353 aa10□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 A0A1W2PQH9 124 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FAM170BA6NMN3 283 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MAGEC1O60732 1142 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ANP32DO95626 131 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TBX18O95935 607 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PRKCGP05129 697 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CD72P21854 359 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TYK2P29597 1187 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 GCKP35557 465 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PDE1BQ01064 536 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TNK2Q07912 1038 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CDH17Q12864 832 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZBTB17Q13105 803 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PPP2R5DQ14738 602 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 E2F5Q15329 346 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms