RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438596.5

TTLL3-216, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-216ENST00000438596 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 TTC22Q5TAA0 569 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 KRT79Q5XKE5 535 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 HID1Q8IV36 788 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 BMPERQ8N8U9 685 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CXorf38Q8TB03 319 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CCDC120Q96HB5 630 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 AIFM3Q96NN9 605 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SLC30A3Q99726 388 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SMR3AQ99954 134 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SIX4Q9UIU6 781 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.4□□□□□ -1.22
TTLL3-216ENST00000438596 CUBNO60494 3623 aa7.4□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 AKAP6Q13023 2319 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 C21orf140B9A014 251 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 MASP2O00187 686 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PRNPP04156 253 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 MCM7P33993 719 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 GPR3P46089 330 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 RRADP55042 308 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 DNASE1L3Q13609 305 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 SLC12A1Q13621 1099 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 CEBPEQ15744 281 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 UGT8Q16880 541 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 DCAF10Q5QP82 559 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 SMC5Q8IY18 1101 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ASB12Q8WXK4 309 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 SMOQ99835 787 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 NUDT9Q9BW91 350 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 KIF3AQ9Y496 699 aa7.39□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PP2D1A8MPX8 630 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 B4DGG1 531 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 F5H423 210 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 CCL21O00585 134 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 B4GAT1O43505 415 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 CLSTN1O94985 981 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 CLDN14O95500 239 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ACPPP15309 386 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PBX1P40424 430 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 SLC11A2P49281 568 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 NEK3P51956 506 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 NDST1P52848 882 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 OR1D5P58170 312 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 ADAM8P78325 824 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 NUCB1Q02818 461 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 FCRL6Q6DN72 434 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.38□□□□□ -1.23
TTLL3-216ENST00000438596 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms