RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TOR1BO14657 336 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TPP1O14773 563 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM228BP0C875 321 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 RARAP10276 462 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 UBASH3AP57075 661 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC10A7Q0GE19 358 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CDKN3Q16667 212 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PRRT3Q5FWE3 981 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 GUSBP11Q6P575 273 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 IFI44Q8TCB0 444 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 BTN2A2Q8WVV5 523 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 BOCQ9BWV1 1114 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa28.12■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 SALL4Q9UJQ4 1053 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CAPN11Q9UMQ6 739 aa28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD36A6QL64 1941 aa28.12■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 BOLA3Q53S33 107 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 KCTD16Q68DU8 428 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 LZTR1Q8N653 840 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPH1Q92598 858 aa28.11■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 CSPG4P5Q96PW8 444 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PSKH2Q96QS6 385 aa28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 RP1P56715 2156 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 LMO7DNF2Z398 122 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 H3BRJ5 948 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CASC3O15234 703 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 BRINP1O60477 761 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SERPING1P05155 500 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP1A2P05177 515 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TSHRP16473 764 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SERPINA4P29622 427 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PEX5P50542 639 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBED6P86452 979 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 INPP5AQ14642 412 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 ALG11Q2TAA5 492 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 ERAP2Q6P179 960 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PGBD5Q8N414 524 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PLA2G15Q8NCC3 412 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 IL12RB2Q99665 862 aa28.1■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 OR1A2Q9Y585 309 aa28.1■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SCNN1BP51168 640 aa28.09■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PPARDQ03181 441 aa28.09■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 LIPIQ6XZB0 460 aa28.09■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 CPED1A4D0V7 1026 aa28.08■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP58Q5T655 872 aa28.08■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CPNE8Q86YQ8 564 aa28.08■■■□□ 2.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TEKT4Q8WW24 435 aa28.08■■■□□ 2.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP69A5D8W1 941 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 MAFKO60675 156 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 IL4RP24394 825 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 ARL4AP40617 200 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 HK3P52790 923 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 AP1S1P61966 158 aa28.07■■■□□ 2.08
TRIOBP-209ENST00000428075 NFATC4Q14934 902 aa28.07■■■□□ 2.08
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