RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417088.2

RPS28-201, Transcript of ribosomal protein S28, humanhuman

TSL 2

Gene RPS28, Length 334 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28-201ENST00000417088 ELOCQ15369 112 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ZNF605Q86T29 641 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ARL10Q8N8L6 244 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 OR1A2Q9Y585 309 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TNFSF15O95150 251 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PRKCGP05129 697 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ALPIP09923 528 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CTSEP14091 401 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 HTR1BP28222 390 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 HTR7P34969 479 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MMP12P39900 470 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 RGRP47804 291 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 LIG3P49916 1009 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 NDST2P52849 883 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TPI1P60174 286 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 UBXN1Q04323 297 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TCEA2Q15560 299 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 KCTD16Q68DU8 428 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ERAP2Q6P179 960 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CLEC14AQ86T13 490 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ARL14Q8N4G2 192 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 KYQ8NBH2 561 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 GPR34Q9UPC5 381 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PCCBP05166 539 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CSNK1DP48730 415 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MTM1Q13496 603 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CA9Q16790 459 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 SRLQ86TD4 932 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 GKN2Q86XP6 184 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TTC9Q92623 222 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 PDXPQ96GD0 296 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 WDR92Q96MX6 357 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 DONSONQ9NYP3 566 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 KLQ9UEF7 1012 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 A0A1W2PQM1 296 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CFAP69A5D8W1 941 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CAPN8A6NHC0 703 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 K7ENP7 123 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 TNFP01375 233 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ITGA2BP08514 1039 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 FERP16591 822 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 DESP17661 470 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CCL7P80098 99 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MYL5Q02045 173 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CLN3Q13286 438 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 MAMLD1Q13495 774 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 CFAP58Q5T655 872 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 AFMIDQ63HM1 303 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS28-201ENST00000417088 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms