RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEP78395 509 aa21.7■■□□□ 1.07
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC153Q494R4 210 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MPP7Q5T2T1 576 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.7■■□□□ 1.07
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SH3BP5-204ENST00000412806 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
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SH3BP5-204ENST00000412806 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZMYND15Q9H091 742 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 PEX13Q92968 403 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 C7orf26Q96N11 449 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 C20orf27Q9GZN8 174 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 TLK1Q9UKI8 766 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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SH3BP5-204ENST00000412806 KCNK13Q9HB14 408 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 CRTAMO95727 393 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 S1PR4O95977 384 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5-204ENST00000412806 CYBBP04839 570 aa21.67■■□□□ 1.06
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