RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 KDM1BQ8NB78 822 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATP2A3Q93084 1043 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ISL2Q96A47 359 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MFSD3Q96ES6 412 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 APOL2Q9BQE5 337 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GGA2Q9UJY4 613 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CDH7Q9ULB5 785 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf81A6NN90 581 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FZD6O60353 706 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 KRT4P19013 534 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NMBRP28336 390 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-FP30511 346 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CD70P32970 193 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LSP1P33241 339 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NNMTP40261 264 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MTHFRP42898 656 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GRIA4P48058 902 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ECT2LQ008S8 904 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 IL9RQ01113 521 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 OLIG2Q13516 323 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 DHCR24Q15392 516 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 DBN1Q16643 649 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 INSCQ1MX18 579 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EML3Q32P44 896 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 BANPQ8N9N5 519 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GPR150Q8NGU9 434 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RIN3Q8TB24 985 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FGF13Q92913 245 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RBBP8Q99708 897 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EPN3Q9H201 632 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPM1 405 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GMNCA6NCL1 334 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 WASH3PC4AMC7 463 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PROB1E7EW31 1015 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LDB2O43679 373 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GLP2RO95838 553 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PRLP01236 227 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MPOP05164 745 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GSTA1P08263 222 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ITGA2BP08514 1039 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ERVK-10P10266 1014 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ADH5P11766 374 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SRCP12931 536 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NFKBIAP25963 317 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CHRNA4P43681 627 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RGRP47804 291 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CCT5P48643 541 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINB8P50452 374 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LIMK2P53671 638 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 BCL2L1Q07817 233 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 IHHQ14623 411 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.85□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms