RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 ZWILCHQ9H900 591 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 A0A087X0T9 212 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 FAM228BP0C875 321 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 RARAP10276 462 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 RALGDSQ12967 914 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC14Q15048 493 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 GUSBP11Q6P575 273 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SPASTQ9UBP0 616 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.66■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CPED1A4D0V7 1026 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 BRINP1O60477 761 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PEX11BO96011 259 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 GP1BAP07359 652 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SERPINA4P29622 427 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SCNN1BP51168 640 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 INPP5AQ14642 412 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ACAP1Q15027 740 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CFAP58Q5T655 872 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 FAXCQ5TGI0 409 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 KCTD16Q68DU8 428 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ERAP2Q6P179 960 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 IL12RB2Q99665 862 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 USP29Q9HBJ7 922 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.65■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 H3BRJ5 948 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TPP1O14773 563 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 SERPING1P05155 500 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TSHRP16473 764 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TGM2P21980 687 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 ITPKBP27987 946 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 ZBED6P86452 979 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 PPARDQ03181 441 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 BCL2L1Q07817 233 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 TCEA2Q15560 299 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 BOLA3Q53S33 107 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.64■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.64■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 OR1A2Q9Y585 309 aa22.64■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 A8MX80 341 aa22.63■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 GM2AP17900 193 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 ARL4AP40617 200 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 HID1Q8IV36 788 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 LZTR1Q8N653 840 aa22.63■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 MAPK15Q8TD08 544 aa22.63■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 LMO7DNF2Z398 122 aa22.62■■□□□ 1.21
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KDELR3-202ENST00000409006 CYP1A2P05177 515 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 PEX5P50542 639 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TPM4P67936 248 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 NFATC4Q14934 902 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 LIPIQ6XZB0 460 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KDELR3-202ENST00000409006 TBATAQ96M53 351 aa22.62■■□□□ 1.21
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