RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 BEX3Q00994 111 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 KDELC1Q6UW63 502 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 LPGAT1Q92604 370 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 ZNF597Q96LX8 424 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 CD300AQ9UGN4 299 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 AK5Q9Y6K8 562 aa18.96■□□□□ 0.63
CBX1-202ENST00000393408 PTPRDP23468 1912 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ARL5CA6NH57 179 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 EPHX2P34913 555 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SCNN1GP51170 649 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PLK1P53350 603 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RALGDSQ12967 914 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 UPP1Q16831 310 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 KLC3Q6P597 504 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CALML6Q8TD86 181 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 DDI1Q8WTU0 396 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ACBD6Q9BR61 282 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 OCEL1Q9H607 264 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 COQ10BQ9H8M1 238 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 DMTF1Q9Y222 760 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ASLP04424 464 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ACAP2Q15057 778 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PCSK7Q16549 785 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 HIC2Q96JB3 615 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PKMYT1Q99640 499 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa18.95■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 GPC4O75487 556 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ODC1P11926 461 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PSMC3P17980 439 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CCR1P32246 355 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CPT1AP50416 773 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 IKBKEQ14164 716 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 NRF1Q16656 503 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 EML3Q32P44 896 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PHF21BQ96EK2 531 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ATP13A1Q9HD20 1204 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 MRASO14807 208 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 NR1H2P55055 460 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 HECTD2Q5U5R9 776 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 FAM45BPQ6NSW5 357 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 BORAQ6PGQ7 559 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 FAM45AQ8TCE6 357 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CASP10Q92851 521 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RANBP9Q96S59 729 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.94■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CSPG5O95196 566 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SLC7A1P30825 629 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PGFP49763 221 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 SNX31Q8N9S9 440 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 RIN3Q8TB24 985 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 OSER1Q9NX31 292 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 MPP6Q9NZW5 540 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 CCDC160A6NGH7 325 aa18.93■□□□□ 0.62
CBX1-202ENST00000393408 E9PAM4 449 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms