RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GALNT8Q9NY28 637 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 STK39Q9UEW8 545 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 KCTD3Q9Y597 815 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC154A6NI56 674 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 C2orf81A6NN90 581 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 E7ENX8 843 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 M0R3G1 203 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 UBXN8O00124 270 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LDLRP01130 860 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ARSAP15289 507 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJB2P25686 324 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DAOAP59103 153 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SEMG2Q02383 582 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NAB1Q13506 487 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PGS1Q32NB8 556 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NADK2Q4G0N4 442 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1W2PQH9 124 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM114B3SHH9 223 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TBC1D4O60343 1298 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ECT2LQ008S8 904 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 VAC14Q08AM6 782 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MICU2Q8IYU8 434 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF217Q8TC41 542 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TEKT5Q96M29 485 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RRN3Q9NYV6 651 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DHRS12A0PJE2 317 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 BTBD19C9JJ37 291 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TOMM70O94826 608 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FESP07332 822 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 AOC1P19801 751 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RAP1GDS1P52306 607 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 INSCQ1MX18 579 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR70Q9NW82 654 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NUP205Q92621 2012 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 H3BSA7 217 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR182O15218 404 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCC1O94876 653 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 OXCT1P55809 520 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 IL5RAQ01344 420 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 VPS28Q9UK41 221 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD42-202ENST00000393389 KLF11O14901 512 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms