RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.37□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.37□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDT14O95848 222 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP2C18P33260 490 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP45Q70EL2 814 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MLYCDO95822 493 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 HDCP19113 662 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL12RB1P42701 662 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 OLFM1Q99784 485 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 DYRK3O43781 588 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPN3P26045 913 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 RGS21Q2M5E4 152 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM35AQ86V20 835 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 POC5Q8NA72 575 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 COQ7Q99807 217 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADAMTS3O15072 1205 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDK18Q07002 472 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP2A13Q16696 494 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 HECTD3Q5T447 861 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CUZD1Q86UP6 607 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINGO1Q96FE5 620 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCF12Q99081 682 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNX6Q9UNH7 406 aa14.36□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAF4O00268 1085 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCL22O00626 93 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR4Q2P0C623 313 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTPAP49638 278 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MMP14P50281 582 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABRQ12979 859 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLD5Q8N7P1 536 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO10Q9UK96 956 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 AHCYL1O43865 530 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACADMP11310 421 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAGP20916 626 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PANX1Q96RD7 426 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLK2Q9NYY3 685 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 DISP2A7MBM2 1401 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MDM4O15151 490 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSMA3P25788 255 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD5Q6N075 450 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP7Q93009 1102 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD11O43934 449 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR6B1O95007 311 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 BNIP1Q12981 228 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 XYLT1Q86Y38 959 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 REPS1Q96D71 796 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPM1MQ96MI6 270 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRIQ9BWK5 157 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBL1XO60907 577 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPIDRQ14159 915 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 INSCQ1MX18 579 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPR180Q86V85 440 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 HOMEZQ8IX15 550 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD3Q96ES6 412 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF208Q9H0X6 261 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 RHOJQ9H4E5 214 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 VPS51Q9UID3 782 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 IPPQ9Y573 584 aa14.35□□□□□ -0.11
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPLO60437 1756 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms